仕事内容:
【募集背景】
米国進出に向けて、人・犬・猫の15,000 SNVsをターゲティングした新規パネルの開発が急務です。同時に、既存の解析パイプラインの最適化と、国際的な学会・論文発表を視野に入れた高度なデータ解析が必要な段階に来ています。
このプロジェクトは単なるR&Dではなく、seeDNAの次の成長を支える事業の中核です。一人目のBioinformaticianとして、パネル開発から臨床導入、そして国際展開まで、プロジェクト全体に関わる貴重な機会です。
【主な業務】
1. NGS Data解析パイプラインの運用・最適化
■ Illumina機器から出力される10Gb以下のFastq Dataを、自社Linux Serverで処理
■ GATK、bcftools、Samtoolsを用いた以下の解析を実行：
- Copy Number Variation (CNV) 解析
- Variants Calling
- 統計解析による品質評価
■ 解析結果の出力・可視化・レポート作成
2. 新規ターゲット配列解析パネルの開発
■ 人・犬・猫の15,000 SNVsを対象とした新規パネル設計
■ パネル設計の最適化（カバレッジ、特異性、検出感度の検証）
■ 実際のNGSデータを用いた新規パネルの検証・改良
■ パネルの臨床的妥当性の確認（検査チームとの共同検証）
3. 検査チームとの協働
■ 8名の検査チームとの定期的な連携
■ 検査結果からのフィードバックループの構築
■ 解析ワークフローの改善提案
4. 研究成果の発表
■ 国際学会での発表準備
■ 論文執筆・投稿（First Author論文の発表を期待）
■ 新しいアルゴリズム・解析手法の開発と発表
【業務の特徴】
■ 最高峰の技術者から直接学べる環境：代表（日本初の胎児DNA鑑定開発者）が直属上長
■ 世界レベルの研究環境：各種AI Tool、高性能自社サーバーを自由に使用可能
■ 実務と学術性の両立：自社サービスの開発と、国際的な研究発表を同時に推進
■ グローバル展開への関与：韓国・ウクライナ・インド・アメリカへの展開プロジェクトに直接貢献
アピールポイント:
【会社紹介】
株式会社seeDNAは、遺伝子検査・DNA鑑定領域において国内で唯一の次世代DNA鑑定機関です。
これまでの実績：
■ 10万人以上のDNA解析実績、鑑定ミス判定0件という品質を維持
■ 国内初の出生前親子DNA鑑定開発に成功
■ 国内唯一Royalty Free NIPT（新型出生前診断）を実施
■ 国内シェアNo.1の法科学検査機関
■ 韓国・ウクライナ・インドへのグローバル展開を実現
現在、さらなる成長フェーズへ： 東京都の「アメリカ進出支援プログラム」に採択され、米国市場への進出を準備中です。この成長を支える中核となるのが、次世代のターゲット配列解析パネルの開発です。
代表 富金 起範は、日本で初めて胎児のDNA鑑定開発に成功した第一人者。 国内唯一のRoyalty Free NIPTを開発し、現在も国内で唯一次世代の特殊DNA鑑定を実施中です。この最高峰の技術者の下で、バイオインフォマティクスの最前線に携わることができます。
求める人材:
【必須要件】
■ 博士号（PhD）取得（分野は問わず。バイオインフォマティクス、情報科学、生物統計学、生命科学等）
■ Python でのプログラミング経験
■ Linux / Unix コマンドライン環境での実務経験
■ NGS データ解析の実務経験（WGS、WES、Target Sequencing のいずれか）
■ 基本的な統計学の理解（分布、仮説検定、回帰分析など）
■ GATK、bcftools、Samtools など標準的な解析ツールの使用経験
■ 英語での論文読解能力（国際学会や学術文献の理解）
【歓迎要件】
■ Copy Number Variation (CNV) 解析の経験
■ Variants Calling パイプラインの構築経験
■ R、Perl、Bash での実装経験
■ 機械学習・ディープラーニング技術の活用経験
■ ゲノム参照データベース（dbSNP、ClinVar、gnomAD等）の活用経験
■ ヘルスケア・医療領域でのNGS解析経験
■ First Author としての論文発表経験
■ 国際学会での発表経験
■ 動物ゲノム（獣医学領域）での解析経験
【こんな方に向いています】
■ 最前線のバイオインフォマティクスに挑戦したい方
■ 基礎研究と実務を両立させたい方
■ 国際的な研究環境で成果を発表したい方
■ ゲノム解析の新しい手法開発に興味がある方
■ 技術者として自らのスキルを極めたい方
勤務時間・曜日:
■月曜日～金曜日、9:00～18:00
■休憩1時間は各自のタイミングでとることができます。
休暇・休日:
- 土、日、祝日、年末年始休業
- 慶弔休暇あり
- 年間休日122日以上
- 6ヶ月経過後の年次有給休暇日数 10 日
勤務地:
東京都足立区竹の塚3-10-1 竹の塚ビル２階 ※転勤はありません。
（最寄駅：東武STライン竹ノ塚駅、JR/東京メトロ北千住駅、TX六町駅）
自転車通勤OKです。ビル内に駐輪場あります。
アクセス:
東武スカイツリーライン竹ノ塚駅より徒歩17分(バスだと6～7分）
または、JR/東京メトロ北千住駅・つくばエクスプレス六町駅からバスで15～20分
給与:
固定残業代あり：月給 ￥400,000 〜 ￥550,000は1か月当たりの固定残業代￥23,260〜￥31,980（8時間相当分）を含む。8時間を超える残業代は追加で支給する。
- 評価基準：First Author論文数、開発実績、技術的貢献度に応じて決定
- ボーナス：固定賞与 最大2ヶ月分
- 勤務時間：9:00〜18:00（休憩1時間／固定時間制）
- 休日休暇：土日祝、年末年始、慶弔休暇／年間休日122日以上
- 試用期間：2ヶ月（条件変更なし）
- 各種手当：皆勤手当（月8,000円）、勤続手当、通勤手当全額支給
待遇・福利厚生:
【福利厚生】
- 各種社会保険完備
- がん保険全額支援、足立区勤労者福祉サービス加入
- 学会参加支援：国際学会参加費、論文投稿費用を会社が全額支援
- 研究環境：各種AI Tool、高性能自社サーバーを自由に使用可能
【職場環境】
- 服装、髪型、ネイルは自由です
- ウォーターサーバー・電子レンジ・冷蔵庫・個人ロッカー完備
- がん保険全額支援、足立区勤労者福祉サービス加入
- 毎週１回、お菓子配布しています！
その他:
【採用人数・選考フロー】
- 採用人数： 1名
- 入社時期： 即日〜応相談
- 選考フロー： 書類選考（CV・学位記・論文リスト提出） → 技術面接 → 役員面接 → 内定
【応募方法】
ご興味のある方は、以下をご提供ください：
- CV（英語または日本語）
- 学位記のコピー（PhD取得証明）
- 発表論文のリスト（First Author、Co-author を区別）
- これまでの開発・研究実績の概要
お問い合わせ： 03-6659-2997 メール： [[email protected]]
雇用形態: 正社員
給与: 400,000円 - 550,000円 月給
平均所定労働時間（1か月当たり）: 162時間
